Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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