Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SynmQ70IV5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SynmQ70IV5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms