Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Syne1Q6ZWR6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms