Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms