Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ssxb3Q6XAS4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ssxb3Q6XAS4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ssxb3Q6XAS4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ssxb3Q6XAS4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ssxb3Q6XAS4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb3Q6XAS4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms