Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms