Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc44a1Q6X893 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms