Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Cxcl3Q6W5C0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Cxcl3Q6W5C0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Cxcl3Q6W5C0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Cxcl3Q6W5C0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Cxcl3Q6W5C0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Cxcl3Q6W5C0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl3Q6W5C0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Cxcl3Q6W5C0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl3Q6W5C0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl3Q6W5C0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl3Q6W5C0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl3Q6W5C0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl3Q6W5C0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl3Q6W5C0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl3Q6W5C0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl3Q6W5C0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl3Q6W5C0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl3Q6W5C0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl3Q6W5C0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl3Q6W5C0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl3Q6W5C0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl3Q6W5C0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl3Q6W5C0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl3Q6W5C0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl3Q6W5C0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl3Q6W5C0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl3Q6W5C0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl3Q6W5C0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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