Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad54bQ6PFE3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms