Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms