Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf1cQ6PDZ2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms