Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd4aQ6PDC8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms