Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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