Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhb9Q6PB60 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhb9Q6PB60 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhb9Q6PB60 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhb9Q6PB60 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhb9Q6PB60 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhb9Q6PB60 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhb9Q6PB60 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhb9Q6PB60 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhb9Q6PB60 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhb9Q6PB60 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhb9Q6PB60 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhb9Q6PB60 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhb9Q6PB60 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhb9Q6PB60 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhb9Q6PB60 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhb9Q6PB60 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhb9Q6PB60 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhb9Q6PB60 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhb9Q6PB60 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhb9Q6PB60 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhb9Q6PB60 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhb9Q6PB60 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhb9Q6PB60 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhb9Q6PB60 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms