Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms