Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms