Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C7

Znf728, Zinc finger protein 728, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf728Q6P5C7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Znf728Q6P5C7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Znf728Q6P5C7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Znf728Q6P5C7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf728Q6P5C7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms