Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Podnl1Q6P3Y9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Podnl1Q6P3Y9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Podnl1Q6P3Y9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Podnl1Q6P3Y9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Podnl1Q6P3Y9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Podnl1Q6P3Y9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms