Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Asic1Q6NXK8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms