Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms