Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc66Q6NS45 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms