Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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