Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms