Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scaf8Q6DID3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scaf8Q6DID3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scaf8Q6DID3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms