Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca2Q6DIC0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms