Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Usp7Q6A4J8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Usp7Q6A4J8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Usp7Q6A4J8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Usp7Q6A4J8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Usp7Q6A4J8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Usp7Q6A4J8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Usp7Q6A4J8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Usp7Q6A4J8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Usp7Q6A4J8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Usp7Q6A4J8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms