Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrcc1Q69ZB0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms