Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms