Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3ipQ68EF0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab3ipQ68EF0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab3ipQ68EF0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms