Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms