Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms