Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms