Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ScxQ64124 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ScxQ64124 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ScxQ64124 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ScxQ64124 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ScxQ64124 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ScxQ64124 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ScxQ64124 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ScxQ64124 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ScxQ64124 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms