Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e1Q64104 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms