Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pan3Q640Q5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms