Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm20854Q62461 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm20854Q62461 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm20854Q62461 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm20854Q62461 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm20854Q62461 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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