Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcncQ62447 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcncQ62447 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms