Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms