Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms