Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttf1Q62187 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ttf1Q62187 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttf1Q62187 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms