Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3cQ62181 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms