Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

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Length 3,357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VcanQ62059 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VcanQ62059 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VcanQ62059 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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VcanQ62059 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VcanQ62059 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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VcanQ62059 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VcanQ62059 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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