Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms