Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms