Protein–RNA interactions for Protein: Q61079

Sim2, Single-minded homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim2Q61079 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim2Q61079 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim2Q61079 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim2Q61079 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim2Q61079 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim2Q61079 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim2Q61079 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim2Q61079 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim2Q61079 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim2Q61079 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim2Q61079 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim2Q61079 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim2Q61079 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim2Q61079 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim2Q61079 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim2Q61079 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim2Q61079 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim2Q61079 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim2Q61079 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sim2Q61079 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sim2Q61079 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sim2Q61079 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sim2Q61079 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms