Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Usf1Q61069 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Usf1Q61069 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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