Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JrkQ60976 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JrkQ60976 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JrkQ60976 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JrkQ60976 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JrkQ60976 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
JrkQ60976 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms