Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Neurod1Q60867 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms