Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf4Q60793 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf4Q60793 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf4Q60793 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf4Q60793 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf4Q60793 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf4Q60793 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf4Q60793 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf4Q60793 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf4Q60793 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf4Q60793 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf4Q60793 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf4Q60793 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf4Q60793 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf4Q60793 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf4Q60793 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf4Q60793 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf4Q60793 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf4Q60793 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf4Q60793 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf4Q60793 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf4Q60793 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf4Q60793 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf4Q60793 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf4Q60793 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf4Q60793 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf4Q60793 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf4Q60793 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf4Q60793 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf4Q60793 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf4Q60793 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klf4Q60793 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf4Q60793 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf4Q60793 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf4Q60793 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf4Q60793 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf4Q60793 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf4Q60793 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf4Q60793 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf4Q60793 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf4Q60793 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf4Q60793 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf4Q60793 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf4Q60793 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf4Q60793 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf4Q60793 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf4Q60793 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf4Q60793 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf4Q60793 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klf4Q60793 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf4Q60793 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klf4Q60793 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf4Q60793 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf4Q60793 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf4Q60793 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf4Q60793 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf4Q60793 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf4Q60793 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf4Q60793 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf4Q60793 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf4Q60793 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf4Q60793 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf4Q60793 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Klf4Q60793 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf4Q60793 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf4Q60793 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf4Q60793 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf4Q60793 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf4Q60793 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf4Q60793 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf4Q60793 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf4Q60793 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf4Q60793 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf4Q60793 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf4Q60793 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf4Q60793 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf4Q60793 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf4Q60793 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf4Q60793 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf4Q60793 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf4Q60793 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf4Q60793 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf4Q60793 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf4Q60793 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf4Q60793 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf4Q60793 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf4Q60793 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms