Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2cQ60772 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms